Efter med nød og næppe at være undsluppet rædslerne i det underjordiske Hive-anlæg kastes Alice tilbage i en krig mellem de levende og de udøde. Hun slutter sig til en lille gruppe elitesoldater anført af Valentine og Carlos, der er hyret til at redde den forsvundne datter af dr. Ashford, skaberen af den muterende T-virus.