På patrulje i Føderationens rum støder U.S.S. Shenzhou på et ukendt objekt, der sætter kaptajn Michael Burnham på sin hidtil største prøve.

Ansigt til ansigt med Klingon-skibe gør U.S.S. Shenzhou klar til en mulig krig, hvis forhandlingerne fejler. Burnham ser tilbage på sin opvækst for rådgivning.

Ombord på USS Discovery indser Burnham hurtigt, at tingene ikke er, som de ser ud til at være, inklusive den mystiske kaptajn Gabriel Lorca.

I en anspændt tid prøver Starfleet at afslutte krigen mod klingonerne, og Burnham vænner sig mere til sin nye stilling på U.S.S. Discovery.

På en mission befinder Lorca sig pludselig i selskab med en krigsfange, løjtnant Ash Tyler, samt den berygtede forbryder Harry Mudd.

Den nytilkomne løjtnant Ash Tyler fascinerer besætningen på USS Discovery. Sarek søger Burnhams hjælp, hvilket vækker minder om hendes fortid.

Da U.S.S. Discoverys besætning prøver at hygge sig til en fest, dukker en uvelkommen gæst op, hvilket får sære og problematiske følger.

U.S.S. Discovery får en vigtig mission og tager til planeten Pahvo for at lære videnskaben bag klingonernes sløringsteknologi at kende.

Lorca trodser Starfleet og benytter U.S.S. Discovery i et forsøg på at afslutte krigen mod klingonerne én gang for alle.

På ukendt territorium må U.S.S. Discoverys besætning tænke kreativt for at bekæmpe hidtil uset modstand og komme hjem i live.

Mens besætningen fortsætter kampen, tager Burnham på en svær mission for at hjælpe U.S.S. Discovery hjem. Tilly prøver at genskabe Stamets' neurofunktioner.

Burnham tager til ISS Charon med en særlig 'gave' til kejseren. Med hjælp fra uventet kant får Stamets klarsyn. Saru beder L'Rells om hjælp.

Lorca planlægger et kup mod kejseren, hvilket får Burnham til at træffe en hurtig beslutning for at redde ikke bare sig selv, men U.S.S. Discovery.

Jacks romance med Anna blomstrer, mens han og resten af holdet efterforsker en cyklists mystiske død under et løb.

Da liget af Christopher Williams bliver fundet på en båd ude midt på havet, tyder alt på, at der er sket en uheldig ulykke. Jack er dog ikke helt så overbevist.

Efter Jack Mooneys afgang ankommer den nye vicekriminalkommissær Neville Parker til øen. Han begynder straks efterforskningen af et formodet selvmord.

Et overlevelseskursus går helt galt, da lederen - en trænet overlevelsesekspert og tidligere elitesoldat - bliver fundet død ude på en øde ø tæt på Saint Marie.

Da ejeren af en frisørsalon bliver slået ihjel for øjnene af sin familie, uden nogen ser, hvad der sker, bliver Neville Parkers efterforskning slået ud af kurs.

Mens politiet efterforsker mordet på en mand, hvis eneste vidne var hans blinde kone, gør Neville sig klar til at rejse. Men er han klar til at forlade paradis?

Da en kvindelig nyhedsvært bliver fundet dræbt i sin pool, er Neville sikker på, at det er hendes populære medvært, der er morderen.

Teamet bliver endnu engang sat på prøve, da en arkæolog forgiftes under en udgravning. Sagen viser sig at være mere kompleks end som så.

Neville og teamet får hænderne fulde, da en lotterivinder bliver fundet dræbt, men så forsvinder liget. Tingene er ikke altid, som de ser ud til.

Et sandfluebid får Neville indlagt på det lokale hospital, og da natten falder på, tager en sygeplejerske sit eget liv. Men det hele virker en smule mystisk.

Da en anerkendt pianist bliver myrdet i sit eget hjem, må Neville og teamet i gang med en omfattende efterforskning, der tager dem tilbage i tiden.

Teamet må løse mysteriet fra fortiden for at finde ud af, hvem der dræbte pianisten og hvorfor. Heldigvis er hjælpen på vej.

En polterabend får et brat ophør, når værten for deres fisketur bliver fundet på en strand med en harpun gennem brystet. Er morderen mon iblandt dem?

En mand tilstår, at han har myrdet sin chef. Han kan dog ikke huske, hvordan det skete. Neville er overbevist om, at de ikke har fat i den rigtige morder.

Da en tilsyneladende simpel kidnapning ender med mord, får Neville og teamet til opgave at finde ud af, hvordan det kunne gå så galt.