Efter at han har været ude for en ulykke, mister Donatello langsomt sin intelligens.

Splinter skal redde padderne, da de lokkes i dødbringende fælder af en ukendt fjende

Raphael bliver venner med Zog, en rum-triceraton, og de kæmper mod Kraang'erne sammen

Padderne hører om Kraang'ernes tilbagevenden. De indser, at en større trussel er på vej mod Jorden

Padderne hører om Kraang'ernes tilbagevenden. De indser, at en større trussel er på vej mod Jorden

Holdet møder den mærkelige rumrobot flugtobotten, der tager dem ud i rummet

Da holdet styrter ned på en måne med en fjende, skal de lægge deres forskelle til side

Da Casey opdager en hyperkube, slipper han et firedimensionelt væsen løs: Wyrm

Padderne flygter til en forladt rumstation, da en dusørjæger forsøger at ødelægge dem

Padderne havner på den onde planet Xaava-Dal

Da rumvæsener invaderer Mikeys hjerne, skal padderne jage dem gennem hans underbevidsthed

Padderne fanges og kastes ind i den triceratonske arena

Padderne vinder Utrom-rådets tillid for at finde en del af sorthulgeneratoren

Padderne skal finde det andet generatorstykke i en oceanlignende del af rummet

Padderne møder deres 1980'er-modstykker i en anden dimension