Da Splinter først muterer, lærer han at overleve og beskytte fire mutantskildpaddeunger.

Paddernes planer om at nyde halloween afbrydes, da monstre truer byen

Renet transporterer holdet til Transsylvanien for at stoppe Savanti Romero

Savanti planlægger at rekruttere Frankensteins monster og slipper sin hær løs i det 21. århundrede

Padderne vender tilbage til en verden styret af monstre og indser, at de har gjort tingene værre

Mona Lisa ankommer til Jorden, men Raphs iver efter at hjælpe hende kan få holdet i problemer

Raph skal få Mona Lisa og Bishop til at arbejde sammen for at besejre en trussel fra rummet

80'ernes Shredder og Krang dukker op i denne dimension og hyrer Bebop og Rocksteady

Padderne træner deres modstykker fra 80'erne til at stå over for den største trussel, de nogensinde er stødt på.

Padderne får hjælp af de mægtige mutantbæster for at stoppe Bebop og Rocksteady

Padderne transporteres til en alternativ dimension, hvor de møder en kaninsamurai.

Usagi fører padderne ind i en hjemsøgt skov fuld af drilske og farlige ånder

Usagi og padderne nærmer sig deres bestemmelsessted og skal hjælpe Kintaro med at fuldbyrde sin skæbne

En ældre og vejrbidt Raphael kæmper mod vejbander i en postapokalyptisk mutant-ødemark

Holdet kører gennem ørken-ødemarken på jagt efter en eneboer, der kan hjælpe dem med at finde en sagnomspunden oase