Det lykkes Rodrigo at bestikke og intimidere sig vej til at blive valgt som Pave Alexander VI.

Den nye pave spilder ikke tiden og konsoliderer magten ved at udpege sine børn til høje embeder.

Rodrigo søger midler til et indbringende ægteskab for Lucrezia. Micheletto beordres til at fjerne truslen fra Della Rovere.

Lucrezias bryllup med Giovanni Sforza, som er motiveret af økonomi og politik, er en katastrofe takket være Juan.

Lucrezia bliver mishandlet af af sin grusomme ægtemand, og hun indleder en affære med en køn staldknægt. Cesare laver en handel med Machiavelli.

Della Rovere når til Frankrig. Han slår en handel af med kongen, hvor de aftaler at invadere Italien og indsætte Rovere på den pavelige trone.

Invasionen af Kong Charles og Della Rovere fortsætter med en uundgåelig sejr i sigte, da franskmændene plyndrer byen Lucca.

Angriberne tager Lucrezia til fange, men hun får lov til at overtale hendes bror Juan til at trække sine tropper tilbage .

Helt forladt, selv af sine kardinaler, møder Alexander Kong Charles med ydmyghed og redder sin trone. Lucrezia føder en søn.

Alexander holder en stor fest. Della Rovere vender tilbage som landsbypræst. Den tidligere prins af Napoli tages til fange.

Paolo vender tilbage til Rom. Giulia og Vittoria viser Alexander de fattiges kår, og en bitter Juan dræber Paolo.

Kong Karl belejrer Rom sammen med nye allierede. Cesara og Vittoria overlister tropperne. Della Rovere søger nye sammensvorne.

Paven bliver bedt om at velsigne en alliance imod Frankrig. Cesare hører, at hans elskede Ursula er blevet dræbt.

Catherina nægter at sværge troskab til paven. Cesare dræber Giovanno. I Rom bliver Alexander næsten dræbt af et lynnedslag.

Alexander er overbevist om, at lynnedslaget var et tegn fra Gud. De politiske problemer vokser, og Juan vil igen overtage militæret.

Juan leder belejringen af Catherinas slot, som brydes efter et overraskelsesangreb af Sforzas styrker. Det kulminerer i en vanvittig ødelæggelse af kunstværker.

Juan lyver om sin indsats ved Forli. Lucrezia flirter med Calvinos bror, og Roveres sammensvorne tager sagen i egen hånd.

Det er påske, men Alexander faster stadig. Fasten afsluttes, og Antonello bliver ny mundskænk. Juan truer Lucrezias barn, og Cesare ved, hvad der skal gøres.

Cesare forfalsker en tilståelse, og Savonarola brændes. Cesare opdager for sent, at paven drikker af en forgiftet kop.

Imens Alexander kæmper for sit liv, kæmper kardinalerne om at overtage pavedømmet. Catherina sender sin personlige snigmorder.

Alexander giver kardinal Sforza en opgave. Han skal påbegynde en efterforskning blandt kardinalerne, som konspirerede imod ham.

De fjernede kardinaler afskediges og fratages deres titler og rigdom. Det resulterer i, at en af kardinalerne sætter Vatikanets skatkammer i brand.

Kardinal Farnese får fast base i skatkammeret, og her opdager han hurtigt Versuccis tyveri. Alexander beordrer et korstog.

Cesares diplomatiske mission til Frankrig er en succes. Han får en ny allieret i ærkebiskop d'Amboise og et løfte om alliance.

Cesare ankommer til Norditalien med en fransk hær. Catharina sender en klud, som er inficeret med pest, og viklet om en besked til Alexander.

Cesare brænder Constanzos palads ned for at inddæmme pesten. Lucrezia søger en magtbase i Napoli.

Pilgrimme strømmer til Rom. Den tyrkiske flåde ødelægges af Mattais jødiske kontakter, og Alexander fritager det jødiske lokalsamfund for skatter.