Den skibbrudne John Blackthornes oplever et sandt kulturchok i mødet med det feudale japanske samfund i begyndelsen af 1600-tallet.

Lord Toranaga giver Blackthorne navnet Anjin-san, og Mariko underviser ham i sprog og skikke.

Blackthorne og Mariko starter en romance. Toronaga fortsætter med at opbygge sin hær til en kamp mod Ishido. Marikos mand, Buntaro, ankommer til Anjiro.

Toranaga gør Blackthorne til sin hjælper og udnævner ham til samurai.

Toronaga opbygger sin hær til en konfrontation med sin største rival. Blackthorne og Mariko kan ikke holde på en hemmelighed, der kan få dem begge dræbt.

Toronaga kæmper mod Lord Ishido om at blive shogun. Mariko kæmper for sit liv i et sidste slag på Osaka Slot.