På Princeton University i 1955 skal Ben finde en skjult formel fra Albert Einstein, som rummer nøglen til atomenergi, før fjendtlige kræfter får fat i den.
Næsten 30 år efter dr. Sam Beckett trådte ind i Quantum Leap-acceleratoren og forsvandt, skal et nyt team, ledet af dr. Ben Song, genstarte projektet for at forstå maskinens mysterier og dens skaber.