Agent Duram bliver lokket i en fælde på GDD's hovedkvarter af Clarices spion, hvilket efterlader hans informant, Amanda, uden nogen at henvende sig til.
I de fredelige 12 kolonier lever familierne Graystone og Adama vidt forskellige liv. Men da en tragedie rammer, flettes deres skæbner sammen i en historie om kunstig intelligens, ambitioner og begyndelsen på cylonernes æra.